第三级自然区域称为小区，仍根据综合分析和主导因素相结合的原则，依不同的亚区内部区域分异规律进行划分。如柴达木盆地是景观上相对一致的内陆盆地，故可划为一个自然亚区。盆地内部，根据湿润程度的不同，可划为东部、西部两个小区，前者为荒漠草原地区，后者为荒漠地区。又如华中区的江南南岭亚区，面积较大，地形结构复杂，可根据地形及因此而引起的气候和自然景观的差异，分为江南低山丘陵盆地、四川盆地、贵州高原、南岭山地和广西北部4个小区，各个小区各有其明显的自然地理特征。
