目录1
1 目录：此原目录，与实际目录相差较大，故原文保存以为资料。其与原书差异，亦不在本篇予以校正，详见正文。
一卷
天人合一论 一
总论 二
元神元质说 三
受形论 四
诊分男女论 五
子形似父母祖伯论 六
命门图说考 七2
2 七：原作“六”，与前一标题下序号重复，故改。
二卷
四元行论 一
四行情图 二
四元变化见象论 三
长生赖补养论 四
四液总论 五
红液黄液 六
黑液 七
白液 八
脉经之血由心炼 九
动觉至细之力德 十
知觉外官总 十一
目之视官 十二
耳之听官 十三
鼻之嗅官 十四
口之味官 十五
身之触官 十六
知觉内司总论 十七
总知司 十八
受相司 十九
分别司 二十
涉记司 二十一
记心法 二十二
记心辩 二十三
寤寐论 二十四
梦论 二十五
嘘吸论 二十六
天形地体图论 第一3
3 第一：原文如此，与序号不合。正文此节列为第一，置于“四元行论”之前。
三卷
经脉营卫呼吸考 一
髭须眉发毫毛考 二
仰人骨度部位图 三
伏人骨度部位图 四
周身骨肉数界论 五
周身骨节长短考 六
内景全图 七
脏腑位次考 八
内景正面图 九
内景背面图 十
鼻口通咽喉论 十一
咽喉分脏腑论 十二
藏府气血多少歌 十三
三焦图说考 十四
手少阳经脉络筋穴图说考 十五
周身骨节三百六十五考 又六1
1 又六：正文此节在“周身骨节长短考六”之后，原脱，比及发现，版已刻成，故补刻作“又六”。
四卷
喉咙通五脏论 一
肺脏图说考 二
肺下左侧图说考 三
肺下左侧图说考 四
手太阴经脉络图说考 五
心脏图说考 六
五脏系心图说考 七
手少阴经脉络图说考 八
心包络图说考 九
气海隔膜图说考 十
手厥阴经脉络图说考 十一
脾脏图说考 十二
脾胃包络图说考 十三
足太阴经脉络图说考 十四
肝脏图说考 十五
足厥阴经脉络图说考 十六
肾脏图说考 十七
足少阴经脉络图说考 十八
五卷
咽嗌通六腑论 一
胃腑图说考 二
足阳明经脉络图说考 三
小肠腑图说考 四
阑门水谷泌别图 五
大小肠会为阑门论 六
大小肠膀胱系考 七
手太阳经脉络图说考 八
大肠腑图说考 九
手阳明经脉络图说考 十
胆腑图说考 十一
足少阳经脉络图说考 十二
膀胱腑图说考 十三
足太阳经脉络图说考 十四
十二经本一脉歌 十五
十五络脉歌 十六
周身正面腧穴铜人大全图 十七
周身背面腧穴铜人大全图 十八
六卷
奇经八脉总论 一
奇经八脉歌 二
任脉图说考 三
督脉图说考 四
阴维脉论 五
阳维脉论 六
阴
脉论 七
阳
脉论 八
冲脉论 九
带脉论 十
七卷
经络色脉主病论 一
腧穴所属补泻法论 二
针法浅深禁宜论 三
禁针腧穴歌 四
禁灸腧穴歌 尻神禁忌图穴歌
手少阳经穴主病 六
手太阴经穴主病 七
手少阴经穴主病 八
手厥阴经穴主病 九
足太阴经穴主病 十
足厥阴经穴主病 十一
足少阴经穴主病 十二
八卷
足阳明经穴主病 一
手太阳经穴主病 二
手阳明经穴主病 三
足少阳经穴主病 四
足太阳经穴主病 五
九卷
任脉俞穴主病 一
督脉俞穴主病 二
奇穴主症 三
岐伯四花穴 四
崔氏四花六穴 五
万氏四花穴 六